Aubameyang ha estado ausente en los dos últimos partidos del Arsenal: victorias ante el Southampton y el West Ham United.
El viernes, Arteta confirmó que el jugador de 32 años tampoco participaría en el viaje del sábado para enfrentarse al Leeds United en Elland Road.
Dijo a los periodistas: “Ha sido un reto porque estas decisiones son difíciles y no son agradables, pero tienes que hacer lo que crees que es correcto”.
Y el técnico español ha tomado recientemente otra decisión importante lejos de las cámaras, que no augura nada bueno para el futuro de Aubameyang en el norte de Londres.
El internacional gabonés espera que la situación siga igual hasta que parta hacia la Copa de África 2020 en Camerún a finales de mes.
No se ha puesto en huelga, ni se ha negado a entrenar en el complejo London Colney del Arsenal tras su destitución como capitán del club.
Sin embargo, se mantendrá en forma por sí mismo mientras el resto de la plantilla absoluta sigue atravesando el periodo invernal, afectado por el virus Covid.
Dado que la AFCON se celebra del 9 de enero al 6 de febrero, la mayoría de los clubes de la Premier League querrán que sus jugadores se marchen lo más tarde posible.
Clubes como el Chelsea, el Liverpool y el Manchester City perderán a figuras clave durante la competición, como Edouard Mendy, Riyad Mahrez y Mohamed Salah.
Pero dadas sus circunstancias actuales, es probable que el Arsenal permita a Aubameyang abandonar el país a la mayor brevedad posible.
Es posible que no represente al club durante otros dos meses, ya que la incertidumbre se cierne sobre su futuro en el Emirates Stadium.
Arteta es probable que profundice en el mercado de fichajes en busca de un nuevo delantero en enero o el próximo verano.
Además de Aubameyang, es poco probable que Alexandre Lacazette y Eddie Nketiah sigan en el Arsenal más allá del final de la temporada.
Los contratos de ambos jugadores expiran en junio, y se espera que partan como agentes libres en busca de minutos regulares en diferentes extremos de sus carreras.
La pegajosa situación de Aubameyang se curará con el tiempo, y se espera que regrese de la AFCON buscando un poco de aire fresco en los planes de Arteta para el resto de la campaña.